Tre perioder af afroamerikanske Chirons liv bliver præsenteret i filmen Moonlight.
Som barn bor Chiron sammen med sin mor, Paula, der er misbruger, i et råt kvarter i Miami. Chiron er et genert, tilbagetrukket barn, der bliver forsømt af moderen, da hun er mere interesseret i at få tilfredsstillet sine egne behov, frem for at tage sig at sin søn
Chiron bliver vejledt af den lokale dealer, Juan, der kan se at Chiron forsømmes.
Kan Chiron komme væk fra den næsten forudbestemte vej i livet, der ligger foran ham, eller kan han følge Juan råd og træffe sine egne beslutninger?
