Året er 1942, og Det Tredje Rige oplever sine glansdage. Den tjekkiske modstandsbevægelse i London planlægger sin
mest avancerede militæroperation under Anden Verdenskrig: Anthropoid.
To unge rekrutter, Jozef Gabcik og Jan Kubis, sendes til Prag for at dræbe en af de mest grusomme nazister – rigeprotektoren Reinhard Heydrich, chef for SS, Gestapo og en af personerne bag det, som kom til at hedde ”den endelige
løsning på det jødiske spørgsmål”, hvilket indebar, at alle europæiske jøder skulle tilintetgøre.
Filmen er baseret på en sand historie.