Sæson seks i Spin-off serien.
I denne sæson slår agenterne "G" Callen, Sam Hanna, specialagent Kensi Blye, LAPD-forbindelsesofficer Marty Deeks, tech-geniet Eric Beale og analytikeren Neil Jones sig sammen for at beskytte operationschefen Hetty Lange fra en dødelig kold krigs-fjende, mens de bliver undersøgt af det amerikanske justitsministerium.
NCIS-vicedirektøren Owen Granger kæmper for at styre enheden, mens de skubber til enhver grænse for at beskytte deres land.